根据职责，广东省台山市食品药品监督管理局设4个职能股（室）（即办公室、食品安全协调股、综合业务股、稽查股）
（一） 办公室
协调局机关日常政务，负责会议、文电、机要、档案、信息、宣传、保密、信访、财务、资产管理等工作；负责行政诉讼和行政复议等法制工作；负责人事、党务、精神文明建设和纪检、监察以及党风廉政建设工作。
（二） 食品安全协调股
组织有关部门拟定食品安全管理的工作规划并监督实施；依法行使食品安全综合监督职能，组织协调有关部门承担的食品安全监督工作；会同有关部门收集、上报本地区食品安全信息；组织实施全市食品安全宣传教育工作；组织协调全市重大、特大食品安全事故的调查处理工作；负责全市食品安全伤亡事故的统计和上报工作；组织协调食品安全专项执法监督活动；组织协调和配合有关部门开展食品安全应急救援工作。
（三） 综合业务股
监督实施处方药和非处方药分类管理制度；监督管理麻醉药品、精神药品、医疗用毒性药品、放射性药品及特种药械；依法监督实施药品经营质量管理规范及药品批发、零售企业资格制度；负责保健品、化妆品、医疗器械日常监督管理工作；收集、上报本地区保健品、化妆品安全信息。
（四） 稽查股（挂稽查分局牌子）
负责药品、医疗器械、保健品、化妆品市场的稽查工作，监督抽查药品、医疗器械、保健品、化妆品质量，依法打击制售假冒伪劣药品、医疗器械、保健品、化妆品的行为，处罚违法违规的责任人；负责对举报投诉药品、医疗器械、保健品、化妆品质量案件或上级布置查处的药品、医疗器械、保健品、化妆品案件进行调查处理。